Homo_sapiens human Hominidae aatagggcccgtatttaccctatagcaccccctctaccccctctagagcc|CACTG-TA|aa|GCTA|act-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|AAGAG|aaccaacac-----|CTCTT|TACAGTG|aaatgccccaactaaatactaccgtatggcccaccataattacccccatac Pan_troglodytes chimpanzee Hominidae ataggacccgtattcactctatagcaccttctctacccctctccagagct|CACTG-TA|aa|GCTA|acc-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|AAGAG|GaccgacaC-----|CTCTT|TACAGTG|aaatgccccaactaaataccgccgtatgacccaccataattacccccatac Pan_paniscus pygmy chimpanzee Hominidae ataggacccgtattcactctataacaccttctctacccctctccaaagct|CACTG-TA|aa|GCTA|acc-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|AAGAG|GaccaacaC-----|CTCTT|TACAGTG|aaatgccccaactaaataccgccgtatgacccaccacaattacccctatac Gorilla_gorilla gorilla Hominidae ataggacccgtattcgccctataatacccctctcatccctctccagagct|CACTG-TA|aa|GCTA|acc-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|AAGAG|tatcggcac-----|CTCTT|TGCAGTG|aaatgccccagctaaataccaccgtatggcccaccataattgccccaatac Pongo_pygmaeus orangutan Hominidae 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Insectivora agcaattcctctcaatcaatttgaaaaatgatcattatcaataatttaat|CACTA-AG|aa|GCTa|g---------|tAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agata-|GGAGa|ccttaa--------|aTTCC|CTTAGTG|taatgcctcaattagacacatcttcatgatttataataattttaactataa Echinops_telfairi small Madagascar hedgehog Insectivora atagttcctttaaaaattttcgaaagttgatcaagctcaatagtctaagg|CATTA-AG|aa|GCTa|ttt-------|aAGC|a-|TTaAC|cttttaa|GTcAA|agaca-|GGGAa|cccta---------|gTCCC|CTTAATG|gtatgccacaattagatacatcaccctgacttatctctattctatcaataa Episoriculus_fumidus Taiwan brown-toothed shrew Insectivora tagtcccactaaaagtattcgaaaaatgatcatcttcaatactataaatt|CATCA-AG|aa|GCTa|aatat-----|cAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GGGAT|TtcaaG--------|ATCCC|CTTGATG|gtatgccacaactagacacctccacatgatttattacaattatatcaatat Sorex_unguiculatus Long-clawed Shrew Insectivora tagttcctctaaaagtatttgagaaatgatcttcttctatgctataattt|CATTA-AG|aa|GCTa|ttg-------|cAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatc-|GAGAG|catcaacc------|CTCTC|CTTAATG|atatgccacaactagacacctcaacatgatttatcaccatcatctcaataa Crocidura_russula white-toothed shrew Insectivora ttgtacccctaagtatttttgaaaaatgatcttcatcaataatttaatct|CATTA-AG|aa|GCTA|tag-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agaat-|gaGAG|cttagac-------|CTCcc|CTTAATG|gaatgccacaactcgacacttccacatgatttatcacaattatctcaatac Chrysochloris_asiatica Cape Golden Mole Insectivora atagtcccactaaaacatttcgaaaactgatcttctacaataacttaatc|CAcTG-AG|aa|GCTa|aatact----|aAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agact-|GAGAG|tttaat--------|CTCTC|CTCAaTG|aaatgccacaattagatacaaacacatgatttattacaattatttctgcca Talpa_europaea European mole Insectivora tagtccctctaaaacatttcgaaaagtggtcatcatctatactataaagt|CATTA-AG|aa|GCTa|ttt-------|aAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agaat-|GAGAG|ctcagac-------|CTCTC|CTTAATG|atatgccacaactagacacatctacatgatttactactattttagcgacca Mogera_wogura Japanese mole Insectivora tagtacctctaaaatatttcgaaaaatgatcttcatccatactataaagt|CATTA-AG|aa|GCTa|acttc-----|aAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GAGAG|ctcaaac-------|CTCTC|CTTAATG|atatgccacaactagacacatcaacatgatttattactattctagcaacca Urotrichus_talpoides Japanese shrew mole Insectivora tagttccactaaaatatttcgaaaaatgatcttcatctatgctataaagt|CATTA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agaat-|GAGAG|cccagac-------|CTCTC|CTTAATG|aatatgccacaattagacacatctacatgatttattactattttagcaaca Rousettus_aegyptiacus Egyptian rousette Chiroptera tagttccactaaaatacttcgaaaaatgatcctcatccatactataaact|CATTA-AG|aa|GCTa|attttc----|aAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agagt-|GGGAG|cgccaac-------|CTCCC|CTTAATG|aaatgccgcaactcgacacatctacatgatttattactatcgtatcaatgc Pteropus_dasymallus Ryukyu flying fox Chiroptera tagtccccctaaaatatttcgaaaaatgatcctcgtccatactataaaat|CATTA-AG|aa|GCTT|atttta----|AAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GGaAG|tactaac-------|CTcCC|CTTAATG|gaatgccacaactcgatacatccacatgatttattaccattctgtccataa Pteropus_scapulatus little red flying fox Chiroptera tagttcccctaaaatatttcgaaaaatgatcctcatccatactataaaat|CATTA-AG|aa|GCTT|atttta----|AAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GGaAG|tacaaac-------|CTcCC|CTTAATG|aaatgccacaacttgatacatccacatgattcattaccattctgtccatga Artibeus_jamaicensis Jamaican fruit-eating bat Chiroptera tagtttctctaaaatactttgaaaaatgatcaacatctatattataagac|CATTA-AG|aa|GCTA|tct-------|TAGC|g-|CTAAC|cttttaa|GTTAG|agatt-|GGGAA|tataagc-------|TTCCC|CTTAATG|atatgcctcaactagatacatcaacttgatttatcacaattttagccacaa Chalinolobus_tuberculatus New Zealand long-tailed bat Chiroptera tagttcccctgaaattctttgaaaaatgatcttcatccataatataactt|CATTA-AG|aa|GCTa|at--------|tAGC|a-|CTAAC|cttttaa|GTTAG|agatt-|GAAAG|cactaat-------|CTTTC|CTTAATG|atatgccacagctagacacatcaacttgattcattacaatcatatccataa Pipistrellus_abramus Japanese house bat Chiroptera taattcccctaaaatattttgaaaaatgatcatcttctataatataatat|CATTA-AG|aa|GCTa|a---------|tAGC|a-|CCAGC|cttttaa|GTTGG|agatt-|GAGAG|tttaaat-------|CTTTC|CTTAATG|acatgccacaactcaacacatcaacttggtttattacaattatatctataa Mystacina_tuberculata New Zealand lesser short-tailed bat Chiroptera 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Perissodactyla tggttccattaagtacctttgaaaaatgatctacatcaatactttaaagt|CATTA-AG|aa|GCTa|ta--------|tAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agact-|GAGGG|tctaagt-------|CCCTC|CTTAATG|atatgccacaactagacacatcaacatgatttattaatatcacatcaataa Balaena_mysticetus bowhead whale Cetacea tagtgcccctggaaaactttgagaaatgatctacatcaatactataacat|CATTA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|gaGAG|cccaaa--------|CTCcc|CTTAATG|atatgccacaactagatacatcaacatgactcctcactatcctatctat Balaenoptera_acutorostrata minke whale Cetacea tggtacccctagaaatctttgaaaaatgatctgcatcaatactataacgt|CGTTA-AG|aa|GCTA|aat-------|TAGC|g-|TCAAC|cttttaa|GTTGA|agact-|gaGAG|cttataa-------|CTCcc|CTTAATG|acatgccacaattagatacatcaacatgactcctcaccatcctttcta Balaenoptera_bonaerensis Antarctic minke whale Cetacea tagtacccctagaaatctttgaaaaatgatctgcgtcaatactataacgt|CATTA-AG|aa|GCTA|aatt------|TAGC|g-|TCAAC|cttttaa|GTTGA|agatt-|gaGAG|cctatga-------|CTCcc|CTTAATG|acatgccacaattagatacatcaacatgactactcaccatcctctctatat Balaenoptera_borealis sei whale Cetacea tagtacccctagaaatcttcgaaaaatgatctgcatcaatactataacct|CATTA-AG|aa|GCTa|aac-------|cAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|gaGAG|cttataa-------|CTCcc|CTTAATG|acatgccacaattagatacatcaacatgactccttactatcctatctatat Balaenoptera_brydei Bryde's whale Cetacea tagtacccctagaaaccttcgaaaaatgatctgcatcaatactataatgt|CATTA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|gaGAG|cttataa-------|CTCcc|CTTAATG|acatgccacaattagatacatcaacatgactccttactattctatctatat Balaenoptera_musculus blue whale Cetacea tagtgcccttagaattctttgaaaaatgatctgcatcaatactataacat|CATTA-AG|aa|GCTa|aat-------|cAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|gaGAG|cctataa-------|CTCcc|CTTAATG|acatgccacaattagacacatcaacatgactccttactatcctatctatac Balaenoptera_physalus finback whale Cetacea tagtacccctagaagtctttgaaaaatgatctgtatcaatactataactt|CATTA-AG|aa|GCTA|aat-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GAGAG|TctataA-------|CTCTC|CTTAATG|atatgccacaattagatacatcaatatgactccttactattctatcaatac Caperea_marginata pygmy right whale Cetacea tagtacctctagaaacctttgaaaaatgatctatatctatactataacat|CATTA-AG|aa|GCTa|aatt------|cAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GAGAG|cccaaa--------|CTCTC|CTTAATG|atatgccacaactagacacatcaacatgacttcttactattctatccatat Eschrichtius_robustus grey whale Cetacea tagtacccctagagatttttgaaaagtgatctgcatcaatactataacat|CATTA-AG|aa|GCTa|aa--------|tAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agact-|GAGAG|CCtacGG-------|CTCTC|CTTAATG|acatgccacaactagatacatcaacatgactccttaccatcctatctat Eubalaena_australis Southern right whale Cetacea tagtacccctagaaaactttgaaaaatgatctacatcaatactataacat|CATTA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|gaGAG|cccaaaC-------|TCccC|TgTAATG|gtatgccacaactagatacatcaacatgactcctcactatcctatctatac Eubalaena_japonica North Pacific right whale Cetacea tagtacccctagaaaactttgaaaaatgatctacatcaatactataacat|CATTA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|gaGAG|cccaaa--------|CTCcc|CTTAATG|atatgccacaactagatacatcaacatgactcctcactatcctatctatac Megaptera_novaeangliae humpback whale Cetacea tagtacccctagaaacctttgaaaaatgatctgtatcaatattgtaacat|CATTA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GAGAA|cctataa-------|TTCTC|CTTAATG|atatgccacaattagacacatcaacatgactccttaccatcctatctatac Berardius_bairdii Baird's beaked whale Cetacea tagtacctttagaaaattttgaaaaatgatctacatccatactataattt|CATTA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agact-|GAAAG|TccaaA--------|CTTTC|CTTAATG|gcatgccacaactagacacatcaacatgacttcttgctatcctatcaa Hyperoodon_ampullatus northern bottlenose whale Cetacea tagtacccttagagaactttgaaaaatgatctacatctatactataattt|CATTA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agact-|GAAAG|cccaaa--------|CTTTC|CTTAATG|gtatgccacaactagatacatcaacatgacttcccgttatcttatcaa Inia_geoffrensis boutu Cetacea tagtacccctagagaactttgaaaaatgatctacatctataacataaact|CATTA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GGGaG|TTataAA-------|CcCCC|CTTAATG|gtatgccacaactaaatacatcaacatggctcctcaccatttcaccca Kogia_breviceps pygmy sperm whale Cetacea 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tagtacccctagagaactttgagaaatgatctgcatctatgttataacct|CATTA-AG|aa|GCTA|ggc-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GGGAG|ctacaca-------|TTCCC|CTTAATG|acatgccacaactagacacatccacatgactcctaacaatcctctcca Physeter_catodon sperm whale Cetacea tagtacccctagaaaactttgaaaaatgatccatctcaatactgtaatct|CATCA-AG|aa|GCTA|aac-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agaat-|gaGAG|CccaaGc-------|CTCcc|CTTGATG|atatgccacaactagacacatcaacatgatttcttaccatcctatccg Platanista_minor Indus River dolphin Cetacea tagtacctctagacaaatttgaaaagtgatcttcatccatactataattt|CATTA-AG|aa|GCTA|aaa-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agact-|gaGAG|acaaga--------|CTCcc|CTTAATG|acatgccacaactagatacatcaacatgactccttactattacatcca Pontoporia_blainvillei franciscana Cetacea tagtacccctagagaacttcgaaaagtgatccgcatctatagtataagct|CATTA-AG|aa|GCTa|aact------|cAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GGAAA|acatgaa-------|TTTCC|CTTAATG|atatgccacaattagatacatcaacatgactcctcaccatctcatccataa Bos_grunniens domestic yak Cetartiodactyla 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Cetartiodactyla tagttccactaaaacattttgaaaaatgatctgcatcaatattataaatt|CATTA-AG|aa|GCTA|aaa-------|TAGC|a-|CTAGC|cttttaa|GCTAG|agact-|GAGGG|cacaata-------|CCTTC|CTTAATG|aaatgccacaactagatacatccacatgattcattataattatatcaatat Sus_scrofa pig Cetartiodactyla tgtcccattaaagtacttcgaaaaatggtcaacatcaatattaacaggtt|CATTG-AG|aa|GCTa|gt--------|cAGC|a-|CTAAC|cttttaa|GTTAG|agatc-|GGGAG|cctaaat-------|CTCCC|CTCAATG|gtatgccacaactagatacatccacatgattcattacaattacatcaataa Hippopotamus_amphibius hippopotamus Cetartiodactyla tagtaccactgcaaactttcgaaaaatgaaccgcatccctattatagact|CATTA-AG|aa|GCTa|g---------|tAGC|g-|CTAAC|cttttaa|GTTAG|agact-|GAGAG|CcaaG---------|CTCTC|CTTAATG|acatgccacaactagacacatcaacatgatttaccaccatcctatccatat Lama_pacos alpaca Cetartiodactyla tggtaccactaaaatattttgaggagtgatctgcctctatattataagct|CACTA-AG|aa|GCTa|gt--------|cAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agaat-|GAGAa|ctataaa-------|cTCTC|CTTAGTG|acatgccgcaactggacacatcaacgtgattcatcacaattctatcaatac Orycteropus_afer aardvark Tubulidentata cttgttccacttaaacatttcgaaaactgatctacatcaataatttaata|CACTA-AA|aa|GCTa|atataa----|aAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agatt-|GAGAG|tattaat-------|CTCTC|TTTAGTG|aatgccacaattagatacaacaccatgatttattacaatcctttcaataat Choloepus_didactylus southern two-toed sloth Xenarthra ctcactcctctcaaacattttgaaaactgatcctcatccacgctctaaat|CATTaGAG|aa|GCTG|ttc-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agact-|GGGAa|cctaaaa-------|cTCCC|CTCAATG|aaatgcctcagctagacacgtcaacatgatccatcactatcctctcaacattc Bradypus_tridactylus pale-throated sloth Xenarthra tcccacttaagcacttcgaagactgatccacactaatgctctaaat|CATcTGAG|aa|GCTa|gta-------|cAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agacc-|GGGAa|cctgaac-------|cTCCC|CTCAATG|agatgccccaattagacacatcaacatggtttattatcatcttctcaatatata Dasypus_novemcinctus nine-banded armadillo Edentata tagtccccctaaaacacttcgaagactgatctacctcaatactttaatct|ccTT-GAG|at|GCTA|taa-------|TAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agact-|GAGAG|tgcaacaaat----|CTCTC|CTCAAtg|aatgcctcaactagatacatccacatgatttattacaattgtatcaatgct Tamandua_tetradactyla southern tamandua Edentata ctagtgccactaaaacactttgaggcctgaactatatcactaatctagat|CATTaAAG|aa|GCTa|aaat------|cAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agact-|GGGAc|ataac---------|cTCCC|CTTAATG|acatgccacaactagatacatcaacatgactagtcacaattacatccatga Elephantulus_sp. elephant shrew Macroscelidea gaaattgtaccacttaaacactttgataactgatcgtctactctataaat|CATTA-AG|aa|GCTa|act-------|gAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|aga-t-|GAGGA|ttcaaatc------|TCCTC|CTTAATG|accatgcctcaactagatacatctacatgattcattacaatcttatcagca Macroscelides_proboscideus short-eared elephant shrew Macroscelidea gaaattgtaccattaaaatactttgataattgaacatctactctctagat|CATTA-AG|aa|GCTA|atg-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|aga-t-|gtGGA|taagtc--------|TCCtc|CTTAATG|aaaatgccacaattagatactactccatgatttacagttatcatatcaata Procavia_capensis cape rock hyrax Hyracoidea aatagtttcactaaaaacctttgaaaactgatcctcatccatattataat|CGTTA-AG|aa|GCTa|atat------|aAGC|a-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agata-|GGGAG|cctacac-------|TTCCC|CTTAACG|aatgccacaactaaacaccatgccctgacccataattattaccaccataat Dugong_dugon dugong Sirenia ctagtcccactcaaatacttcgaagactgatcagcatctctactataaga|CATTG-AG|ta|GCTA|aac-------|TAGC|g-|TTAAC|cttttaa|GTTAA|agtat-|GAGAG|ccgaac--------|TTCTC|CTCAATG|aatgcctcaactagacacaactacatgattcatcacaatcttatctatgct Mammuthus_primigenius woolly mammoth Proboscidea ctagttccacttaagtactttgaaagctggtcagcatcactagcataat|CATTA-AG|aa|GCTA|taa-------|TAGC|a-|CTAAC|cttttaa|GTTAG|agtat-|GAGAA|catagaa-------|TTCTC|CTTAATG|aatggaacgaatagatatcattatctgattactagcagtcgtaattgttct Elephas_maximus Asiatic elephant Proboscidea actagttccacttaagtactttgaaagctggtcagcatcactagcataat|CATTA-AG|aa|GCTA|taa-------|TAGC|a-|CTAAC|cttttaa|GTTAG|agtat-|GAGAA|catagaa-------|TTCTC|CTTAATG|aatggaacgaatagatattattatttgattactagcagtcgtgattgtact Loxodonta_africana African savanna elephant Proboscidea actagttccacttaaatactttgaaaactggtcagcatcactagcacaat|CATTA-AG|aa|GCTA|taa-------|TAGC|a-|CTAAC|cttttaa|GTTAG|agtat-|GAGAA|cacagaa-------|TTCTC|CTTAATG|aatggaacgaatagatattattatttgattactagcagtcgtaattgtact Dasyurus_hallucatus northern quoll Metatheria agaaataacgaccttaaaatattttgaaaattggtcgcatataatgcaaa|catctttg|aa|taac|ataaatagta|ctta|a-|gtact|atagagt|ttaac|actcc-|ctcaa|agcta---------|-----|-------|tgcctcaactaaacacatcagcatgattttacgttgccggtctaactatc Phascogale_tapoatafa brush-tailed phascogale Metatheria tattagaggtagcaaccttaaaatattttgaaaactgatcacatatgatg|caaac-at|ct|ttga|gaa-------|aaca|a-|tataa|tacttaa|gtatt|aacgg-|agttt|agcccctcct----|caaag|cct----|atgcctcaattagaaacatcagcttgatttcacgttgccggcctaaccat Sminthopsis_crassicaudata fat-tailed dunnart Metatheria agaaatatccacccttaaatattttgaaaactgatcgcacataatgcaat|cttctttg|ag|aaac|tattataatg|cttc|a-|gtatt|attagag|tataa|cacctc|ctcaa|--------------|agc--|-----ct|atgccgcaactcaacacctccacttgactgtacgtaattgccttcactct Sminthopsis_douglasi Julia Creek dunnart Metatheria tattagaaatgtccaccctcaaatactttgaaaactggtctcacatgata|cagac-tt|ct|ttga|gaa-------|aact|a-|acata|atactta|agtat|tatta-|gagtc|tagtacctcc----|tcaaa|gctt---|atgcctcaactgaacacctcaacttgactgcacgtaatcggcttcaccct Didelphis_virginiana North American opossum Metatheria agaaatagcctcactaaaatatttcgagaaatgatcttctataatgcaat|catttttg|ag|ttat|ttata-----|----|--|-----|tatttaa|tataa|tcgag-|accta|agaaac--------|tcctc|aaaataa|ccatgcctcaactaaatacttcaacatgaaccctaaccatttcactaata Metachirus_nudicaudatus brown four-eyed opossum Metatheria agaaatagcctcactaaaatattttgagaaatgatcttctataatgcaat|catttttg|ag|ttac|atat------|attt|ta|aatat|aatcgag|atcta|aaaat-|ctcct|--------------|caaaa|caacc--|atgcctcaactagatacttcaacatgaaccctcactatcttactaataatt Monodelphis_domestica gray short-tailed opossum Metatheria aatgacctccctaaaatatttcgaaaaatgatcctccataatgcaagcat|attta-ag|ca|atta|gtc-------|tata|c-|ttttg|gtatgca|agaga|tataa-|taatc|tccttaaata----|-----|-------|aaatgcctcaactcgacacttcaacatgaaccttaacaattatactcata Thylamys_elegans Elegant Fat-tailed Opossum Metatheria aataacttcacttaaatattttgaaaagtgatcatctataatgcaatcat|--ttt-tg|ag|ttat|aaatta----|----|--|taata|cttttag|ggtat|aaaag-|agatt|taatat--------|ctcct|caaaaca|acatgccacaactagacacttccacatgatcctctattatcgtacttat Macropus_robustus wallaroo Metatheria agaaataaccactctaaaatatttcgaaaaatgatcttctataatgcaat|catttttg|ag|aaac|ccagtg----|----|--|taaat|actacaa|gtatt|at-aa-|ggcct|gataaa--------|ccctc|aaaacca|atgccacaactagacacatcaacatgactcctaaccattaccctaatgat Potorous_tridactylus long-nosed potoroo Metatheria agaaataaccacactaaaatatttcgaaaaatgatcctctataatgcaat|catct-tt|ga|gaaa|tta-------|ttat|a-|aatac|tatacgt|atttt|aaggc-|cctaa|aaagccctca----|aaacc|a------|atgcctcaactagatacctcaacatgactcttaactattattctaataat Pseudocheirus_peregrinus common ring-tailed possum Metatheria agaaataacctcactaaaatattttgaaaagtgatcctccataatgcaat|cattt-tt|ga|gaaa|gaa-------|cacc|a-|atact|acaaaca|agtat|acaag-|gaata|taattattcc----|ctcaa|aacc---|atgccacaactagatacttcaacatgatttataactattatccttataat Tarsipes_rostratus honey possum Metatheria agaaataaccactctaaaatatttcgaaaagtgatcctctataatgcaat|catct-tt|ga|taat|tct-------|agta|a-|acaat|cattatt|gttaa|aa----|ggtca|tcttacc-------|ttatc|aaagaaa|atgccacaactagatacttctacatgattcctaactattattttaatagt Trichosurus_vulpecula silver-gray brushtail possum Metatheria agaaataacaacactaaaatattttgaaaaatggtcttctataatgcaat|cattttta|ag|ataa|ccataa----|----|--|-taca|ttaaagt|atta-|---aa-|ggatt|taaaaat-------|ccctt|aaaacat|atgccacaacttgatacttcaacatgattcctaacaatttccctcataat Vombatus_ursinus common wombat Metatheria gataaccacattgaaatatttcgagaaatgatcttctataatgcaatcat|--ttt-tg|ag|tgca|aacta-----|----|--|--ata|ctgtaa-|gtatt|aaaaa-|ggttc|aaa-----------|cctct|caaaaca|catgccacaactaaacacatcaacatgatccctaaccattaccctgatagt Notoryctes_typhlops marsupial mole Metatheria tgaaataactacattaaaatacttcgagaaatgatctcatactatacaat|cgtaa-ct|tt|attt|tct-------|gtac|t-|tccgt|acataaa|aggac|tttaa-|caccc|tacaa---------|-----|-------|atgcctcaactcgacacctcaacatgacttttagttatctttctaataac Dromiciops_gliroides monito del monte Metatheria gatatctacgctaaaatatttcgaaaaatggtcttctatgatgcaatcat|--ttt-tg|ag|taga|acccaa----|----|--|--ata|ccgct--|agtat|tttaa-|ggaat|taaaaat-------|ccctc|aaaac--|ccatgccacaattagacacttcaacatgatttctaactattacccttatg Caenolestes_fuliginosus silky shrew opossum Metatheria aataacaactctaaaatatttcgaaaaatgatcttcaataatgcaatcat|ctttgag-|--|at--|aaaa------|at--|--|-aaat|atttt--|-attt|tcaa--|gggat|ttaact--------|atccc|ctcaaac|catatgcctcagctagatacatccacatgatccataactattatcctaata Rhyncholestes_raphanurus Chilean shrew opossum Metatheria aatagcaactctaaaatacttcgagaaatgatcttcaataatgcaatcat|--ctt-tg|ag|aata|aaaata----|----|--|--aat|atttt--|--att|ttcaa-|gggat|ttaattat------|cccct|caaacca|tatgcctcaactagacacctctacatgatttataactattactttaatg Echymipera_rufescens_australis Rufous Spiny Bandicoot Metatheria agaaatgaccactctcaaatatttcgaaaaatggtcttccataatgcaat|catttttt|ga|ggcc|tatcaa----|----|--|tatct|ctgaata|ttgtt|aagat-|ttaac|cat-----------|ccctc|aaaaaca|atgccgcaacttgatacttctacatgactattagtaattttcctaataat Isoodon_macrourus northern brown bandicoot Metatheria agaaatgaccacactaaaatatttcgaaaaatggtcttccataatgcaat|catttttt|ga|ggcc|tatca-----|----|--|--ata|tctct--|gaata|ttgtt-|aagat|ttaaccat------|ccctc|aaaaaca|tatgccacaacttgacacttcaacatgactattagtaatcttcctaataa Macrotis_lagotis bilby Metatheria agaaatgaccactctcaaatatttcgaaaaatggtcctccataatgcaat|cattt-tt|tg|aggc|cta-------|tcaa|t-|atctc|tgaatat|tgtta|agatt-|taacc|atccctcaaa----|aaca-|-------|atgccacaacttgacacatcaacatgactattagtaattctccttataat Perameles_gunnii eastern barred bandicoot Metatheria agaaatgaccactcttaaatatttcgaaaaatggtcttccataatgcaat|cattt-tt|tg|aggc|cta-------|tcaa|t-|atctc|tgaatat|tgtta|agatt-|taacc|atccctcaaa----|aacat|-------|atgccacaacttgacacttcaacatgacttctagttattttcctaataat Tachyglossus_aculeatus Australian echidna Monotremata cattaaaacacttcgagaactgatcctcttcaatgatgtcaacct|CATAA-AG|aa|GCTA|tag-------|TAGC|a-|gTAAC|cttttaa|GTTAa|agacc-|GAGAt|atcct---------|tTCTC|CTTTATG|atatgccccaattagacacatctacctgatttatagcaattcttcttata Zaglossus_bruijni long-beaked echidna Monotremata agtcccattaaaacacttcgagaattgatcctcttcaataatgtcaacct|CATAA-AG|aa|GCTA|tag-------|TAGC|a-|gTAAC|cttttaa|GTTAa|agacc-|GAGAt|atact---------|tTCTC|CTTTATG|acatgccccaactagatacatctacctgatttataacaatctttcttataattttcaccatttatggcatcttccaactgaaagtag Ornithorhynchus_anatinus platypus Monotremata agttcccctaaaatatttcgaaaactgaacttcttcgataatgtcaactt|CATAA-AG|aa|GCTa|ttg-------|cAGC|a-|gTAAC|cttttaa|GTTAa|agatt-|GAGAt|acact---------|tTCTC|CTTTATG|acatacctcaactagacacatccacctgatacacaaccattttgctgataa Alytes_obstetricans_pertinax midwife toad Anura agtaccactaaaaaccttcgaagactgatcatcatcaatactagatgcct|CACTA-AG|aa|GCTT|acagggagc-|AAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agatt-|GGTGa|cccccga-------|cCACC|CTTAGTG|aaatgccacagcttaacccaagcccctgatttgctattcttctcttctcat Bombina_bombina fire-bellied toad Anura agtgcctttaaaaacctttgaaaactgatcttcatcaatactagaagcct|CACTA-AG|aa|GCTA|atacagaa--|TAGC|a-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agaca-|GGTGA|cctaa---------|TTACC|CTTAGTG|aaatgccacaactcaacccaggcccatgatttgctatcttaatcttttcat Bombina_orientalis Oriental fire-bellied toad Anura cgtccccttgaaaacttttgaaaactgatcttcatcaatactagaaacct|CACTA-AG|aa|GCTA|atatagaa--|TAGC|a-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agata-|GGTGG|ccctaa--------|TCACC|CTTAGTG|aaatgccacaactcaacccaagcccatgatttgctatcctaatattctcat Discoglossus_galganoi Portugal painted frog Anura agtccccttaggaacgttcgaaaactgatcttcatcaatgctagaagcct|CACTA-AG|aa|GCTa|atagggtgc-|aAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|aattt-|GGTGa|ctcccaa-------|cCACC|CTTAGTG|aaatgccgcagttaaacccaggcccctgatttgccatcctggtattctcct Buergeria_buergeri Buerger's frog Anura ttccaatctctaattttctaacttggcttcaagaagcccaaaacagaaac|CATTA-AG|aa|GCTa|tacaggct--|cAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agata-|GGTGc|ttccga--------|cCACC|CTTAATG|aatgccccaactaaacccggacccatgatttattacatttattttagcatg Fejervarya_limnocharis Boie's wart frog Anura tgagactcttccaatcccaaattttctgtcttgattaaaatctagcacat|CATTA-AG|aa|GCTA|tagg------|TAGC|g-|tCAGC|cttttaa|GCTGc|agaca-|GGTGa|ttccgc--------|cCACC|CTTAGTG|acatgcctcaactactaccggaaccatgattctatatcttctttttctcat Hyla_chinensis Chinese tree toad Anura tttacctattaaagaatttctagactgatcttctgcctcagaaaccgcct|CACTA-AG|aa|GCTa|taggacc---|aAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agaca-|GGTGa|cctccaa-------|cCACC|CTTAGTG|gatgccacaattagaccccataccatgattttcaattttatttgcatcatg Kaloula_pulchra Malaysian narrowmouth toad Anura ccttccagtttcaaatttcctaaattgatcatcaatctcacaagattcct|CATTA-AG|aa|GCTa|tagga-----|cAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agaca-|GGTGa|ttccaa--------|cCACC|CTTAATG|gatgcctcaactcatcccagacccatgattctttatcttcatgtcatcatg Microhyla_heymonsi Taiwan rice frog Anura cctaccagtcccagactttttaaactgatcattaatttctcaagattcct|CATTA-AG|aa|GCTa|tagga-----|cAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agaca-|GGTGa|ctccaa--------|cCACC|CTTAATG|gatgcctcaactgatcccggacccatgattccttatttttctctcttcatg Limnonectes_fujianensis Fujian large-headed frog Anura 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agtaccgctaaccgactttgaaaactgatcttcatcaatactagaagcat|CAcTA-AG|aa|GCTA|AatagggcaT|TAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agatt-|GGTGa|ctcccaa-------|cCACC|CTTAaTG|atatgccacagttaaacccaggcccatgattcctaatcctaatcttttcct Xenopus_tropicalis Silurana tropicalis Anura agtcccactaaacgacttcgagaactgatcttcatcaatactagaagcct|CACTA-AG|aa|GCTa|aacagggcc-|aAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agact-|GGTGa|ctcccaa-------|cCACC|CTTAGTG|atatgccacaactaaacccaggcccatgattcgctattctaattttctcgt Ambystoma_andersoni Anderson's salamander Salamandroidea ccacaccattaggacacttccaaaactgatcctcttcaatacaagaata|CATTA-AG|aa|GCTT|TcacggatA-|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTAT|atttc-|GGTGa|cttccaa-------|cCACC|CTTAATG|acatgccacaactaaaccctggcccctgatttgcaatcctaatcatatcttg Ambystoma_californiense California tiger salamander Salamandroidea accacaccattaggacacttccaaaactgatcctcttcaatacaagaata|CATTA-AG|aa|GCTT|TcacggatA-|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTAT|tattc-|GGTGa|cttccaa-------|cCACC|CTTAATG|atatgccacaactaaaccctggcccctgatttgcaatcttaatcatatcttg Ambystoma_dumerilii Lake Patzcuaro salamander Salamandroidea ccacaccattaggacacttccaaaattgatcctcttcaatacaagaata|CATTA-AG|aa|GCTT|TcacggatA-|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTAT|acttc-|GGTGa|cttccaa-------|cCACC|CTTAATG|atatgccacaactaaaccctggcccctcatttgcaatcctaatcatgtcttg Ambystoma_laterale blue-spotted salamander Salamandroidea actacaccattaatacacttccaaaactgatcttcctcaatacaagaata|CATTA-AG|aa|GCTT|TcacggatA-|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTAT|aactc-|GGTGa|cttccaa-------|cCACC|CTTAATG|atatgccacaactaaaccctggcccctgacttgcaattttatttatatctt Ambystoma_mexicanum axolotl Salamandroidea accacaccattaggacatttccaaaactgatcctcttcaatacaagaata|CATTA-AG|aa|GCTT|TcacggatA-|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTAT|atttc-|GGTGa|cttccaa-------|cCACC|CTTAATG|acatgccacaactaaaccctggcccctgatttgcaatcctaatcatatctt Ambystoma_tigrinum_tigrinum Eastern tiger salamander Salamandroidea accacaccattaggacacttccaaaactgatcctcttctatacaagaata|CATTA-AG|aa|GCTT|TcacggatA-|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTAT|aattc-|GGTGa|cttccaa-------|cCACC|CTTAATG|atatgccacaactaaaccctggcccctgatttgcaatcttaatcatatcttg Aneides_flavipunctatus black salamander Salamandroidea aacaccattaagtaattttcaaagctgatcctcttccctatcaaacctat|CATTA-AG|aa|GCTT|tcatgaat--|AAGC|a-|aTAGC|cttttaa|GCTGg|agttc-|GGTAA|taaa----------|TTACC|CTTAATG|atatgcctcaattaaacccgagcccatgatttttaatttttataatatcct Aneides_hardii Sacramento mountain salamander Salamandroidea aacaccactaaattatttccaaaactgatcctccttcatattaaactcct|CATTA-AG|aa|GCTT|tcacggat--|AAGC|a-|aCAGC|cttttaa|GCTGa|aactc-|GGTGG|cctccaa-------|TCACC|CTTAATG|acatgccgcaattaaacccggacccctgattcttaattttcaccttatcat Batrachoseps_attenuatus California slender salamander Salamandroidea aaccccattacaccactttcaaacttgatcttctctaatattagattcct|CATTA-AG|aa|GCTT|ccacggat--|GAGC|a-|aCAGC|cttttaa|GCTGc|agaaa-|GGTGA|cttccta-------|TCACC|CTTAATG|gtatgccacaactaaacccaagcccttgactttccatctttttgatatcct Batrachoseps_wrightorum Batrachoseps wrighti Salamandroidea aacccccctaaactattttcaaagctgatcttcttctatattagaatcct|CATTA-AG|aa|GCTT|cacggat---|AAGC|a-|cCAGC|cttttaa|GCTGt|aacaa-|GGTGA|cttccaa-------|TCACC|CTTAATG|atatgcctcaacttaacccaaacccatgactactcttctttattgtatctt Bolitoglossa_n._sp._RLM-2004 mushroomtongue salamander Salamandroidea aaccccactaacacactttcaaaactgatcctcatcaatactagaaatct|CATTt-AG|aa|GCTT|tcacgt----|AAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|aatc--|GGTAG|ctgcaa--------|TTACC|CTtAATG|acatgccacaactcaacccacacccatggtttttaatccttataatatcat Desmognathus_fuscus dusky salamander Salamandroidea aactcccttaaattactttcaagcttgagcctctcacatattagaaattt|CATTA-AG|aa|GCTT|tcatggat--|AAGC|a-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agttc-|GGTGc|tcccaa--------|tCACC|CTTAATG|atatgccacaattaaaccctaacccatgatttttaatttttattacatcat Desmognathus_wrighti pygmy salamander Salamandroidea 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four-toed salamander Salamandroidea cacttcacttgcacactttaaagactgatcttccaacatactagaatcat|CAcTA-AG|aa|GCTT|ttatgac---|AAGC|a-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agta--|GGTGa|caccaa--------|cCACC|CTTAaTG|atatgcctcagctaaacctagccccatgattctatattttaattatgtcct Hydromantes_brunus limestone salamander Salamandroidea tacctcccttaataattttcaaaactgatcatcctccttattagaatcct|CATTA-AG|aa|GCTT|TcatA-----|AAGC|a-|aTAGC|cttttaa|GCTAg|agttc-|GGTGt|ttataa--------|tCACC|CTTAATG|atatgccacagcttaacccggacccttgattttttattttcacaacatctt Oedipina_poelzi quarry worm salamander Salamandroidea aacccagttgaatcactttcaagactgatcatactctatactagaatcct|CATTA-AG|aa|GCTT|tcacgat---|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTAT|agtc--|GGTGt|attcga--------|cCACC|CTTAATG|acatgcctcaactaaacccacgcccgtgattctttattttagtattatctt Phaeognathus_hubrichti Red Hills salamander Salamandroidea 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salamander Salamandroidea agccccactaactgagttccaaagctgatcttcttcaatactagaatcct|CATTA-AG|aa|GCTA|acatgga---|TAGC|g-|ACAGC|cttttaa|GCTGT|agctc-|GGTGa|ttccaa--------|cCACC|CTTAATG|atatgcctcaactcaacccagacccctgattctttattttttttacatctt Stereochilus_marginatus many-lined salamander Salamandroidea ggcccccttagttgaattccaaaactgatcttcctctatactagaatcct|CATTA-AG|aa|GCTT|ccatggat--|AAGC|a-|aCAGC|cttttaa|GCTGg|aaccc-|GGTGa|cctccga-------|cCACC|CTTAATG|acatgcctcaactcaacccagacccttgattctttatttttacagcatctt Thorius_n._sp._RLM-2004 Mexican pygmy salamander Salamandroidea aaccacactagcccaatttcaaaactgatcttcctctatactagagtcct|CGTTG-Aa|aa|GCTT|tcatgt----|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTAT|agtc--|GGTGa|ctacaa--------|cCACC|cTCAACG|aaatgccacaactcaaccccgccccctgattcttcattcttttaatatcat Lyciasalamandra_atifi Lycian salamander Salamandroidea 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Andrias_japonicus Japanese giant salamander Cryptobranchoidea tacttccttaattaacttcataaattgatcttcattaatactagatgcct|CATTA-AG|aa|GCTT|acaac-----|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTAT|agatc-|GGTGA|ctaac---------|TCACC|CTTAATG|atataccacaattatcacccggaccatgatttgccatttttataatctcct Ranodon_sibiricus Siberian salamander Cryptobranchoidea cactccattgaatcattttcaaaactgatcttcatctatattagaactat|CATTA-AG|aa|GCTT|tcaacc----|AAGC|a-|ATAGC|cttttaa|GCTGT|agatc-|GGTGa|tttaac--------|cCACC|CTTAATG|atatgccacaattaaaccctgggccatgatttgctatttttcttatgtcat Ichthyophis_bannanicus Banna caecilian Gymnophiona agctacaccatactttgaattcctaacatgaactacaatagtagaaacct|CACTA-AG|aa|GCTa|acacgga---|cAGC|a-|CTAGC|cttttaa|GCTAG|cacg--|GGTGG|ccaccaa-------|TCACC|CTTAGTG|atatgccacaattaaacccatccccatgattcctaattttcctactttcat Ichthyophis_glutinosus Ceylon caecilian Gymnophiona 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caecilian Gymnophiona ggtaccagttagtcactttgaagcatgatctacccttatgatagaaacct|CATTA-AG|aa|GCTa|cacgga----|cAGC|a-|TTAGC|cttttaa|GCTAA|acacc-|GGTGa|ccaccaa-------|cCACC|CTTAATG|atatgccacaactataccctgccccgtgatttataatttttatattaacat Amphisbaena_schmidti Schmidt's worm lizard Amphisbaenia caacccctctaatcaacttcgaaaactgatccgcctcactagctacct|CACTA-AG|aa|GCTt|acacca----|cAGC|a-|CTAGC|cttttaa|GCTAG|cgag--|GGGGc|at------------|gCCCC|CTTAGTG|acatgcctcaacttaaccctgctccctgactatacctccttatcctgactt Bipes_biporus five-toed worm lizard Amphisbaenia ctatcccaacaaagcactttactgcctgaataatagaactggcagctt|CACTA-AG|aa|GCTT|ccgcac----|AAGC|a-|CTAGC|cttttaa|GCTAG|cgag--|GGGCa|cg------------|aGCCC|CTTAGTG|attatgccacaactaaaccctgccccttgattccccctactactcctaacct Bipes_canaliculatus four-toed worm lizard Amphisbaenia aatccgttccaacaaaacactttaccacatgaatggccaaactggcct|CACTA-AG|aa|GCTT|ccacatgc--|AAGC|a-|CTAGC|cttttaa|GCTAG|cgag--|GGGCa|cg------------|tGCCC|CTTAGTG|gcatgccacagctaaatccaaccccatggttcccgctactactactaattt Bipes_tridactylus three-toed worm lizard Amphisbaenia aatccatcccttccatacacttcaccgactgaatatccaaactggtct|CACTA-AG|aa|GCTT|acacac----|AAGC|a-|CTAGC|cttttaa|GCTAG|agag--|GGGCt|ag------------|tGCCC|CTTAGTG|acatgccacaactagacccaaccccatgattcgcactactcattctaacct Diplometopon_zarudnyi Zarudnyi's worm lizard Amphisbaenia cagtaccattaaaacactttgaaacctgatccacttcaatactaactt|CACTA-AG|aa|GCTT|actc------|AAGC|a-|CCaGC|cttttaa|GCcGG|agag--|GAGAC|ttg-----------|GTCTC|CTTAGTG|aatgccacaactgaacccggccccatgacttatactacttatgctgacctg Geocalamus_acutus wedge-snouted worm lizard Amphisbaenia ccgtaccactaaaacattttgagaattgatctacatctctcactatct|CACTA-AG|aa|GCTt|acgcta----|tAGC|a-|CTAGC|cttttaa|GCTAG|cgag--|GGATt|ca------------|aATCC|CTTAGTG|atatgcctcaactgaaccccgcaccctgatttctattacttatctttactt Rhineura_floridana Florida worm lizard Amphisbaenia ccacattaaaacacttcgaaacctgatcaacaataatactttaacaat|CACTA-AG|aa|GCTt|ata-------|tAGC|a-|CTAGC|cttttaa|GCTAG|agac--|GGAAc|agcca---------|cTTCC|CTTGGTG|atgtgccacaactaaaccccgctccatgattacttatttttctactaacct Abronia_graminea green arboreal alligator lizard Anguimorpha gcccaatcaaccacttcgaaaactgagtcacacaaacactagcctcat|CATTA-AG|aa|GCTt|tta-------|cAGC|a-|TTAGC|cttttaa|GCTAA|agaa--|GGGCc|tat-----------|aGCCC|CTTAATG|aatgcctcaactaaacccaggaccatgactaataaccttcctaatcacctg Shinisaurus_crocodilurus crocodile lizard Anguimorpha cacccttaaatcactttgaaaactgaaccacactaaccatatcctcct|CATTt-AG|aa|GCTt|tta-------|cAGC|a-|TTAGC|cttttaa|GCTAA|agaa--|GGGGC|cgtt----------|GCCCC|CTcAATG|acatgccgcaactaaatccagctccatggttactaatcctgattatatcct Cordylus_warreni Warren's spiny-tail lizard Scincomorpha cacaattaaaacacttcgaaaattgatcttcctcaatactctctgcat|CACTt-AG|aa|GCTT|gtt-------|GAGC|aC|TCAGc|cctttaa|tCTGA|Gaaa--|GGGGA|tacct---------|TCCCC|CTtAGTG|atatgccacaactaatcctaaacccttggttcttaacttttttattctcat Eumeces_egregius mole skink Scincomorpha 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