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agatgtagtctgactatttctgtacgtctccatctactgatgagggtctt|ACTCTTT|ta|GTAT|aagca------|GTAC|c|GTTAA|cttccaa|TTAAC|cag-t|TTTGA|caacac-----|TCAAA|AAAGAGT|aattaacttcgtcctagctctgacaattaacaccctccttgccctactact Pongo_pygmaeus_abelii Sumatran orangutan Hominidae agacgtagtctgactgtttctgtacgtctccatctactgatgaggttcct|ACTCTTT|ta|GTAT|aaaca------|GTAC|c|GTTAA|cttccaa|TTAAC|tag-t|TTTGa|caacgc-----|cCAAA|AAAGAGT|aattaacttcgtcctagctctaacagtcaacaccctcctagccctgctact Hylobates_lar common gibbon Catarrhini agatgtggtttgactgttcctatatgtctccatctactgatgaggatcct|ACTCTTT|tA|GTAT|aaaca------|GTAC|T|GTTAA|cttccaa|TTAAC|cag-c|TTCGA|taacgc-----|TCGAA|AAAGAGT|aatgaatctggcattagccctaataattaatacactcctagccctactact Macaca_mulatta rhesus monkey Catarrhini ggatgttatctgactactcctctatatttctgtctattgatgaggatcct|ACTCTTT|ta|GTAT|aacaa------|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|cag-t|TTTGA|caacat-----|TCAAA|AAAGAGT|aattaatctagtgctagccctaacaatcaacaccctattaacctcgctact Macaca_sylvanus Barbary ape Catarrhini agatgttgtttgactgcttctctatatttctatttattgatgaggatctt|ACTCTTT|ta|GTAT|aacca------|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|cag-t|TTTGA|caacat-----|TCAAA|AAAGAGT|aattaacctagcgctagccttaataaccaacaccctgttaacctcactact Papio_hamadryas hamadryas baboon Catarrhini agatgtcatttgactgttcctttatatctctatttactgatgagggtctt|ACTCTTT|ta|GTAT|aatta------|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|cag-c|TTTGA|caatat-----|TCAAA|AAAGAGT|aattaacctgatactagccctaacagtcaacacccttctaaccgcactact Cercopithecus_aethiops African green monkey Catarrhini agatgttgtatgattactcctctacatctctatttactgatgaggatcct|ACTCTTT|ta|GTAT|aacta------|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|cag-c|TTTGA|cagtat-----|TCAAA|AAGGAGT|aatcaacctagtactagctctaacaatcaacacccttttaacctcgctact Colobus_guereza guereza Catarrhini agatgttgtctgactatttctctatatctccatttactgatgaggttcct|ATTCTTT|ta|GTAT|agcca------|GTAC|a|gcTGA|cttccaa|TCAac|tag-c|TCCGA|tcaacac----|TCGGA|AAAGAAT|aattaacctagtattgatcctaacaattaataccctcctaaccctaatact Trachypithecus_obscurus dusky leaf monkey Catarrhini 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agacgtagtctgacttttcctatacgtctccatttattgatgaggatcct|ACTCcCT|ta|GTAT|aatta------|ATAT|a|ACTGA|cttccaa|TTAGT|aga-t|TCTGa|agaaac-----|cCAGA|AGaGAGT|aattaacctgtacactgttatcttcattaatattttattatccttagcact Rattus_norvegicus Norway rat Rodentia agatgtagtttgactattcctatacgtttctatctattgatgaggatcct|ACTCcCT|ta|GTAT|aaaca------|ATAC|a|ACTGA|cttccaa|TCAGT|taa-t|TCTGA|aaaaac-----|TCAGA|AGaGAGT|aattaacctacccattatcatcacaattaacatcaccttatcctttatcct Nannospalax_ehrenbergi Ehrenberg's mole-rat Rodentia agacgtaatctgacttttcctatatgtatcaatctactgatgagggtcct|ATTCTTT|tA|GTAT|aacaa------|GTAC|T|TTTGA|cttccaa|TCAAA|cag-a|TCAGA|AcaaacT----|TCTGA|AAAGAAT|aataaacttactaatcaccataataaccaacatcagcctttccatagtcc Microtus_kikuchii Taiwan vole Rodentia agacgtagtatgactattcctatatgtatctatctactgatgaggatcat|ACTTTCT|ta|GTAT|aaaca------|GTAC|g|tCTGA|cttccaa|TCAGt|tag-t|TCTAG|aacaac-----|CTGGA|AGAAAGT|aatcaacttaatactcatcttactaactaacattaccctaactattgccct Myoxus_glis fat dormouse Rodentia 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agatgtagtttgattattcctttacgtatcaatttactgatgaggttcat|ACTCcCT|ta|GTAT|tacta------|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|cag-c|CTCGG|taaaac-----|CCGAG|AGaGAGT|aattaatcttcttcttgctttaataacaaacatttcattagcttctctact Chrysochloris_asiatica Cape Golden Mole Insectivora agatgtagtatgacttttcctatatatctcaatttattgatgaggctcat|ATTCTTT|ta|ATAT|aaata------|ATAT|a|GTTGA|cttccaa|TCAAT|aaa-t|TCTGG|tcaacc-----|CCAGA|AAAGAAT|aattaacctaataatcaccctattcattaactcttcgattgcaatactact Talpa_europaea European mole Insectivora agacgttgtgtgactattcctgtatgtctctatttattgatgagggtcat|ATTCTTT|ta|GTAT|TaaccA-----|GTAC|g|GTTGA|cttccaa|TCAAC|tag-t|CTCGG|tataac-----|CCGAG|GAAGAAT|aattaatatactactaacaatcaccgtaaatacactactatcctctatttt Mogera_wogura Japanese mole Insectivora tgacgtagtttgactattcctttatgtatccatttactgatgaggctcat|ATTCTTT|ta|GTAT|TaattA-----|GTAC|a|GCTGA|cttccaa|TCAGC|tag-t|CTTGG|taaact-----|CCAAG|AAAGAAT|aattaatatactattaacaattacagtaaatacacttctatcttccatctt Urotrichus_talpoides Japanese shrew mole Insectivora agatgtagtatgactattcctctacgtctctatttactgatgaggatcat|ATTCTTC|tA|GTAT|TaaaaA-----|GTAC|T|GCTGA|cttccaa|TCAGC|cag-t|CTCAG|taacaaac---|CTGAG|GAAGAGT|aattaatatactacttacaattatcattaatacactcctgtcatcaattct Rousettus_aegyptiacus Egyptian rousette Chiroptera agatgtagtatgactattcctgtatgtatccatctattgatgaggctctt|ACcCTTT|ta|GTAT|aaaca------|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|tag-c|TTCGG|tatacc-----|CCGAA|AAAGaGT|aataaacctgatattaacattattcatcaatacactacttgcatctttact Pteropus_dasymallus Ryukyu flying fox Chiroptera agacgttgtatgactattcctgtacgtctccatctattgatgaggttcct|ACcCTTT|ta|GTAT|aaata------|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|tag-c|TTCGG|tacaat-----|CCGAA|AAAGaGT|aattaacctaatagtaacacttctcaccaacacgctactagcatcactact Pteropus_scapulatus little red flying fox Chiroptera agacgttgtctgactgttcctatacgtctccatctattgatgaggttcat|ACcCTTT|ta|GTAT|aaata------|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|tag-c|TTCGG|tcataat----|CCGAA|AAAGaGT|aattaacctaataattacgctcctcaccaatacactgctagcatcactact Artibeus_jamaicensis Jamaican fruit-eating bat Chiroptera agatgtagtatgacttttcctatatgtatccatctattgatgaggatcct|ATTCTTT|ta|GTAT|TaataA-----|GTAC|a|ACTGA|cttccaa|TCAGT|tag-t|TCCGA|taaaat-----|TCGGA|AAAGAAT|aataaacatagccattacactattaacaaatacatttctagcaagcctcct Chalinolobus_tuberculatus New Zealand long-tailed bat Chiroptera agatgttgtatgactattcctatatgtatctatctattgatgaggctcat|ATTCTTT|ta|GTAT|cattta-----|GTAC|a|ACTGA|cttccaa|TCAGT|tag-a|TCTGG|aaaacc-----|CCAGG|AAAGAAT|aattaattttatactaacactgctcattaataccctgctggcactattact Pipistrellus_abramus Japanese house bat Chiroptera agatgtagtatgattatttctatatgtatctatttattgatgaggctcat|ATTCTTT|ta|GTAT|TatttA-----|GTAC|G|ACTGA|cttccaa|TCAGT|Tag-a|CTTGG|actaac-----|CCAAG|AAAGAAT|aattaattttatattaacattatttaccaacaccctactagcactactgct Mystacina_tuberculata New Zealand lesser short-tailed bat Chiroptera agatgtagtctgacttttcctgtacgtgtctatctattgatgaggctctt|ATTCTTT|ta|GTAT|TaattA-----|GTAC|g|GTTGA|cttccaa|TCAAT|tag-t|TTCGG|tcaagt-----|CCGAA|AAAGAAT|aataaatatagcattaacattacttgtcaacaccctactggcatctctatt Rhinolophus_monoceros Formosan Lesser Horseshoe Bat Chiroptera agacgtcgtatgactattcctgtacgtatctatctattgatgaggatctt|ATTCTTT|ta|GTAT|TaaatA-----|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|cag-t|TTCGG|tagact-----|CCGAA|AAAGAAT|aataaactttatattaacccttctaacaaacaccttgctagctctactgct Rhinolophus_pumilus Okinawa least horseshoe bat Chiroptera agacgtcgtatgactattcctatacgtatctatctattgatgaggttcct|ATTCTTT|ta|GTAT|TaaacA-----|GTAC|G|ATTGA|cttccaa|TCAAT|Cag-t|TTCGG|taaact-----|CCGAA|AAAGAAT|aataaactttatattaacccttctaacaaacactttgctagctctactgct Acinonyx_jubatus cheetah Carnivora agatgtagtttgactattcttatacgtttccatttattgatgaggatctt|ATTCCTT|ta|GTAT|TaataA-----|GTAC|a|GTTGA|cttccaa|TTAAC|cag-t|TTCGG|tatagc-----|CCGAA|AAGGAAT|aataaacattatactcgccctactcactaacacgctcctatccacactact Felis_catus cat Carnivora agacgtagtttgactattcctatacgtttctatttattgatgaggatcct|ATTCCTT|ta|GTAT|TaataA-----|GTAC|a|GTTGA|cttccaa|TCAAC|cag-t|TTCGG|tataac-----|CCGAA|AAGGAAT|aataaatgtaatacttgccttacttaccaatacactcctgtccacactact Ursus_americanus American black bear Carnivora 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Cetartiodactyla agacgtggtatgattattcctctacgtatccatctattgatgaggttcat|ATTCTTT|ta|GTAT|TaactA-----|GTAC|a|GCTGA|cttccaa|TCAGC|tag-c|TTCGG|tataac-----|CCGAA|AAAGAAT|aataaacctaatactagctcttttaaccaactttacattagcctcactact Muntiacus_crinifrons black muntjac Cetartiodactyla agacgtagtatgactgttcctttatgtatctatctattgatgaggctcat|ATTCTTT|ta|GTAT|caacca-----|GTAC|a|ACTGA|cttccaa|TCAGT|tag-t|TTCGG|tataac-----|CCGAA|AAAGAAT|aataaacctaatactagcccttctaactaattttacattagcctcactact Muntiacus_muntjak muntjak Cetartiodactyla agacgtagtatgattattcctttacgtatccatctattgatgaggctcat|ATTCTTT|ta|GTAT|TaaccA-----|GTAC|a|ACTGA|cttccaa|TCAGT|tag-t|TTCGG|tatagc-----|CCGAA|AAAGAAT|aataaatctaatactagcccttctaactaattttgctctagcctcactact Muntiacus_reevesi Chinese muntjac Cetartiodactyla agacgtagtatgactattcctctacgtatctatctattgatgaggctcat|GTTCTTT|ta|GTAT|caacca-----|GTAC|a|ACTGA|cttccaa|TCAGT|tag-t|TTCGG|tgcagc-----|CCGAA|AAAGAAT|aataaacctaatactagcccttctaactaactttacactggcctcactact Sus_scrofa pig Cetartiodactyla 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agatgtagtttgactactcctctacgtctcaatttattgatgaggctcat|GTcCTTT|ta|GTAT|aacaa------|GTAC|a|ATTGA|cttccaa|TCAAT|cag-c|TCCGa|caataaac---|cCGGA|AAAGaAC|aatcaacctaattctaacccttctaattaactcagcactagccctactact Bradypus_tridactylus pale-throated sloth Xenarthra gtagtatgactattcctctacgtttcaatttattgatgaggctcat|ATTCTct|ta|GTAT|aacaa------|GTAC|a|GTTGA|cttccaa|TCAAC|cag-T|TCCGG|caacaaga---|CTGGA|AaAGAAT|aattaacttaattattaccctactgatcaactctacactaacctcactgctagt Dasypus_novemcinctus nine-banded armadillo Edentata agatgtagtctgactattcctatacgtttccatctattgatgaggctcat|GCTCTAT|ta|GTAT|TaagcA-----|GTAC|a|GTTGA|cttccaa|TCAAC|tag-a|TTCGG|tatcaac----|CCGAA|ATAGAGC|aattaatattataattacactattcatcaacatatccctagcctccttact Tamandua_tetradactyla southern tamandua Edentata ggatgtagtctgactattcctctatgtatcgatctattgatgaggctctt|ACCCTTT|ta|GTAa|aaataa-----|gTAC|a|GCTGA|cttccaa|TTAGC|aag-t|TCCAG|acaaac-----|CTGGA|AAAGGGT|aattaatatagtattaactctactaactaacattaccttagccctactact Elephantulus_sp. elephant shrew Macroscelidea 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Metatheria agatgtagtttgacttttcctatacgtgtcaatttactgatgaggttcat|ATTTTTC|tA|GTAT|aatta------|GTAC|T|acTGA|TTtccAA|TCAtt|aag-t|TCTGG|gtcaaa-----|CCAGA|GAAAAAT|aattaatcttattattacattaattaccaattccttactagccactattat Monodelphis_domestica gray short-tailed opossum Metatheria agacgttgtatgactattcctctatgtatccatctattgatgaggttcct|ATTTTTC|tA|GTAT|aatta------|GTAC|T|acTGA|TTtccAA|TCAtt|aag-t|TCTGG|GtaatT-----|CCAGA|GAAAAAT|aattaatctcatagttactcttctagtaaattctctcctagctacaatcgt Thylamys_elegans Elegant Fat-tailed Opossum Metatheria agatgtagtttgactattcttatacgtctctatttattgatgaggctctt|ATTTTTC|tA|GTAT|aatta------|GTAC|T|acTGA|TTtccAA|TCAtt|aag-t|TCCGG|gtaaaa-----|CCGGA|GAAAAAT|aataaatcttattatagtcctattagtaaattctactttggctacaatc Macropus_robustus wallaroo Metatheria agatgtagtatgactcttcctatacgtgtcaatctattgatgaggctcat|ATTTTTC|tA|GTAT|aatta------|GTAC|T|acTGA|TTtccAA|TCAtt|aag-t|TCTGG|ataaca-----|CCAGA|GAAAAAT|aattaacctcatcattacattaattatcaacactgcattatccacgatcat Potorous_tridactylus long-nosed potoroo Metatheria 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agatgtagtatgacttttcttatatgtatcaatctactgatgaggctcat|ATTTTTC|tA|GTAT|aatta------|GTAC|T|acTGA|TTtccAA|TCAtt|aag-t|TCTGG|gtaaaa-----|CCAGA|GAAAAAT|aatgaatttaataatcacattaatcattaattcatcactagcaaccatcat Tachyglossus_aculeatus Australian echidna Monotremata agatgttgtatgactattcctgtatgtctcaatttattgatgaggctcat|ATTTTTC|ta|GTAT|TaattA-----|GTAC|a|AGTGA|cttccaa|TCACT|aag-t|TTTGG|tctaat-----|CCAAA|GAAAAGT|aattaacctattaatttcacttctaatcaacacttgtctagccaccatttt Zaglossus_bruijni long-beaked echidna Monotremata agatgttgtatgacttttcctgtatgtctcaatttattgatgaggctcat|ATTTTTC|ta|GTAT|TaattA-----|GTAC|a|AGTGA|cttccaa|TCACT|aag-t|TTTGG|tctaat-----|CCAAA|GAAGAAT|aatcaatctattaatttcacttctaatcaacacttgtctagccaccatttta Ornithorhynchus_anatinus platypus Monotremata cgacgttgtatgactcttcttatacgtttcaatttattgatgaggctcat|ATTTCTC|ta|GTAT|caatta-----|GTAC|a|AGTGA|cttccaa|TCATT|aag-t|TTTGG|tctcaac----|CCAAA|GAGAAAT|aattaacctagtaattgctctcctaattaacactggtctagccactatcct Alytes_obstetricans_pertinax midwife toad Anura 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Salamandroidea gatgttgtttgattattcctttacgtctcaatctactgatgaggatcat|ATCTTTT|tA|GTAT|aatta------|ATAC|T|tATGA|cttccaa|TCATt|taa-t|CTTAG|tttaaac----|CTAAG|AAAAGAT|aatgaatttattaatattaatatttatattttcctctatactatctttaat Aneides_flavipunctatus black salamander Salamandroidea agatgttgtttgattattcctttatgtatcaatttactgatgagggtctt|GTCTTTT|ta|GTAT|aat--------|ATAT|T|AATGA|cttccaa|TTATT|Aga-t|TTCAG|ttgaat-----|CTGAA|AAAAGAC|aataaatattttattaacactaattgttacaatcttaatttcaactatttt Aneides_hardii Sacramento mountain salamander Salamandroidea agatgttgtatgattattcctctatatttcaatttattgatgaggatctt|GTCTTTT|ta|GTAT|aaa--------|ATAT|a|AATGA|cttccaa|TTATT|aga-t|TTCAG|ttaaat-----|CTGAA|AAAAGAC|aatgaacatcttactaatattaattattacaataattatctcagctacttt Batrachoseps_attenuatus California slender salamander Salamandroidea tgatgtagtatgactttttttatatgtctcaatttattgatgaggatcct|GTCTTTT|ta|GTAT|aaaa-------|ATAT|a|AATGA|cttccaa|TTATT|aga-t|CTTAG|ttgtt------|CTAAG|AAAAGAC|aataaacctaatcttattaatgttaataattactattttagtgtcaacact Batrachoseps_wrightorum Batrachoseps wrighti Salamandroidea tgatgtagtctgactatttttatttgtttcaatctattgatgaggatcct|GTCTCTT|ta|GTAT|aaa--------|ATAT|a|AATAA|cttccaa|TTATT|aga-t|CTTAG|taatt------|CTAAG|AAGAGAC|aatgaacttaatcctaacaatacttattacctctgtactcctatcaatttt Bolitoglossa_n._sp._RLM-2004 mushroomtongue salamander Salamandroidea agatgtagtctgacttttcctttacgtatcaatctattgatgaggatcct|GCTTCTT|ta|GTAT|aaa--------|ATAT|A|AATGA|cttccaa|TTATT|Tga-t|CTTAG|ctaac------|CTAAG|AAGAAGC|aatgaactctatcatagtaatgctgattatatctgttattttatcaacttt Desmognathus_fuscus dusky salamander Salamandroidea agatgttgtatgactgtttctatatgtttcaatctactgatgaggatcat|GTCTTTT|ta|GTAT|aaa--------|ATAT|a|AATGA|cttccaa|TTATT|aga-t|CTTGG|tttaat-----|CTAAG|AAAAGAC|aatgattattatgtttataataactattaccacaattatttcaattacttt Desmognathus_wrighti pygmy salamander Salamandroidea 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Salamandroidea tgatgtagtctgattattcctttatgtatcaatctactgatgagggtcat|GTCTTTT|ta|GTAT|aaaa-------|ATAT|A|AATGA|cttccaa|TCATT|Tga-t|CCTAG|ataac------|CTAGG|AAAAGAC|aatgaacattattacgatacttttaattacattaattctgtcttccatttta Hydromantes_brunus limestone salamander Salamandroidea agatgttgtatgattatttctctatgtatctatttattgatgaggatctt|ATCTTTT|ta|GTAT|aaaaa------|ATAT|a|atTGA|cttccaa|TCAct|tga-c|TTTAG|tttaat-----|CTAAA|AAAAGAT|aattaatattatcatactcatactattttttacattaaccatctcaattat Oedipina_poelzi quarry worm salamander Salamandroidea tgatgtagtatgactattcctatatgtctcaatttattgatgaggctcat|GTCTTTT|ta|GTAT|aaaa-------|ATAT|a|AATGA|cttccaa|TCATT|aga-t|CTTAG|atat-------|CTAAG|AAAAGAC|aatgaatacaaccaccacaacactactaatcacagctttattatcaatcat Phaeognathus_hubrichti Red Hills salamander Salamandroidea ggacgttgtttgactatttttatatgtatcaatttattgatgaggatctt|GTCTTTT|ta|GTAT|aaa--------|ATAT|a|AATGA|cttccaa|TTATT|aga-t|CTTAG|ttttaac----|CTAAG|AAAAGAC|aatgaacattattttaacaataataattataacttcaattatttcaaccat Plethodon_cinereus red-backed salamander Salamandroidea agatgtcatttgactattcctttatgtatcaatctactgatgagggtcct|GTTTTTT|ta|GTAT|aaa--------|ATAT|a|AATGA|TTtccAA|TCATT|aga-t|CTCAG|caaaac-----|CTGAG|AAAAGAC|aatgaacaccctcctatttataataattattacaacacttatttcaactat Plethodon_elongatus Del Norte salamander Salamandroidea agacgttgtctgactattcctttatgtctcaatttattgatgaggatcct|GTCTTTT|ta|GTAT|aaa--------|ATAT|a|GATGA|cttccaa|TTATC|aga-t|CTTAG|ctaaaac----|CTAAG|AAAAGAC|aatgagccttattccattaataataattgttacaacccttatctccattat Plethodon_petraeus Pigeon Mountain salamander Salamandroidea agacgtcatctggcttttcctttatgtgtcaatatattgatgagggtcct|GTCTTTT|ta|GTAT|aaa--------|ATAT|a|AATGA|cttccaa|TCATT|aga-t|CTCAa|caaaac-----|cTGAG|AAAAGAC|aattaatcttattctgctcatattaattataacaaccctcatctcaattac Pseudotriton_ruber red salamander Salamandroidea agacgtagtatgactattcctttatatttcaatttattgatgagggtcct|GTCTTTT|ta|GTAT|aaaa-------|ATAC|a|AATGA|cttccaa|TCATT|taa-t|CTTAG|taaaaat----|CTAAG|AAAAGAC|aatgaacctaattttacttacattattatttacaacaactctatccaccat Stereochilus_marginatus many-lined salamander Salamandroidea agacgtagtgtgactattcctttatatctcaatttactgatgaggatctt|GTCTTTT|ta|GTAT|aaa--------|ATAC|a|AATGA|cttccaa|TTATT|aga-t|CTTAG|tataaac----|CTAAG|AAAAGAC|aatgagcccaattctattaatgctacttctttcagcaaccctgtctgccct Thorius_n._sp._RLM-2004 Mexican pygmy salamander Salamandroidea agacgtagtttgacttttcctttatgtatcaatttactgatgaggatctt|GTCTTTT|ta|GTAT|aaaa-------|ATAC|a|AATGA|cttccaa|TCATT|caa-t|CTTAG|ctgcc------|CTAAG|AAAAGAC|aatgaataccacaatactaatactaattagcaccacactcctatcagccct Lyciasalamandra_atifi Lycian salamander Salamandroidea agatgtagtctgactattcctgtatgtttcaatttactgatgaggatcat|GTCTTTT|ta|GTAT|aata-------|GTAC|g|AATGA|cttccaa|TCATT|aaa-t|CTTAG|tcataat----|CTAAG|AAAAGAC|agtgaacttaattacactaatacttattatctcagcagctttatcaacaat Paramesotriton_hongkongensis Hong Kong warty newt Salamandroidea 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Siberian salamander Cryptobranchoidea agatgttgtttgacttttcctctacgtctctatctattgatgaggatcat|ATCTTTT|ta|GTAa|aataa------|aTAC|a|AATGA|cttccaa|TCATT|aaa-t|CTTAG|ttaaaat----|CTAAG|AAAGGAT|aatgaatttaattataattataataataatttcaacagttttatcactaat Ichthyophis_bannanicus Banna caecilian Gymnophiona agacgtagtatgactattcttatacgtgtcaatctactgatgaggatcat|ACTTCTC|ta|GTAT|accaca-----|ATAC|c|AATGG|cttccaa|CCATT|aaa-t|CTTAG|ctcaaac----|CTAAG|GAGAAGT|acatgacaatagttatgatattaacaacaaccgcacttattactgtcctta Ichthyophis_glutinosus Ceylon caecilian Gymnophiona agacgtagtttgactattcctatatgtgtcaatttactgatgaggatcat|ACTTCTC|ta|GTAT|acaca------|ATAC|c|AATGG|cttccaa|CCATT|aaa-t|CTTAG|ctttaat----|CTAAG|GAGAAGT|acatgacaataatcactatttacatgacaaccgcactcattattattctaa Rhinatrema_bivittatum two-lined caecilian Gymnophiona ggatgtagtttgacttttcctttatgtctctatctactggtgaggatcct|acCGCCC|ta|GTAt|aaaca------|tTAC|a|AATGA|cttccaa|TCATT|tta-t|CTTGG|cctaacc----|CCAAG|GGGCGat|acaatgacaactaccatcttaataactttagctatctcgatagtattagct Scolecomorphus_vittatus banded caecilian Gymnophiona agatgttgtttgactcttcctttacgtttcaatttactgatgaggatctt|ACCTTTT|tA|GTAT|aatca------|ATAC|T|AGTAA|tttccac|TTACT|aaa-t|CCTAa|ttt--------|aTAGG|AAAAGGT|gtatgcacatacccatattaattcctctaactattgcaattgtactattac Typhlonectes_natans caecilian Gymnophiona agatgttgtgtgactattcctttacgtgtcaatttattgatgaggatcat|GCTCTCT|ta|GTAa|aaata------|aTAC|a|AATGA|cttccac|TCATT|taa-t|CTTAG|acccgc-----|CTGAG|AGAGGGC|atatgttaataatctacattcttctcaccactacaattccctccatccttc Uraeotyphlus_cf._oxyurus_MW-212 Indian caecilian Gymnophiona agatgtagtttgattattcctttacgtatcaatttactgatgaggatcat|ACCTTCC|ta|GTAT|aaaca------|ATAC|a|AGTGG|cttccaa|CCACT|aaa-t|CTTAa|ttaacat----|cTAAG|GGAAGGT|atatgacattaattacagtctgcatttcaactgccttaacaatagcattaa Amphisbaena_schmidti Schmidt's worm lizard Amphisbaenia atgtagtctgactgttcctgtacatctccatctactgatgaggcgcat|ACTTTTC|ta|GTAT|aactaa-----|GTAC|a|GGcGA|tttccac|TCaCC|tag-c|CCcGA|cacca------|TCtGG|GAAAAGT|aatgacacttatcttaatattttacacaatactacttattaccctaatatt Bipes_biporus five-toed worm lizard Amphisbaenia atgttgtctgattgttcctttatatttcaatctactgatgaggatcct|ACTTTTC|ta|GTAT|agcaca-----|GTAT|a|AGTGA|cttccac|TCACT|agg-c|CCTaa|ttaaa------|ccAGG|GAAAAGT|aataaccctagccaccatattcttcgccgccttcgcgctatccgccattct Bipes_canaliculatus four-toed worm lizard Amphisbaenia acgtagtatgactgtttctctacatttcaatctactgatgaggctcat|ACTTTTC|ta|GTAT|aataca-----|GTAT|a|AGTGA|cttccac|TCACT|agg-c|CTTAA|taaa-------|TTAAG|GAAAAGT|aatgaccctggccaccatatttttcaccatactactactatccttcctact Bipes_tridactylus three-toed worm lizard Amphisbaenia acgtagtctgactattcctttatatttcgatctactgatgaggatcat|ACTTTTC|ta|GTAT|aaacaca----|GTAT|a|AGTGA|cttccac|TCACT|agg-c|CTTAA|aaaa-------|TTAAG|GAAAAGT|aatagccctatccatcatactcctaaccaccatagtactgtccgcactact Diplometopon_zarudnyi Zarudnyi's worm lizard Amphisbaenia atgtagtatgacttttcctctatatttcaatctactgatgaggctcat|ACTTTTC|ta|GTAT|aacca------|GTAC|a|GATGA|cttccac|TCATC|tag-c|CTTGA|atagc------|TCAAG|GAAAAGT|aatgacaatcataactataataatcatcatactacttattactatcgcact Geocalamus_acutus wedge-snouted worm lizard Amphisbaenia atgtagtatgactcttcttatacatctcaatttattgatgaggctcat|ACCTTTC|ta|GTAT|actta------|GTAC|a|GGTGA|cttccac|TCATC|agg-c|CTTAA|tccat------|TTAAG|GAAAGGT|aatgactattctactaacattaggcattataatagccatgtcaattattct Rhineura_floridana Florida worm lizard Amphisbaenia acgttgtatgactattcctatatgtctcaatctactgatgaggctcat|GCTCTTC|ta|GTAT|aaacca-----|ATAC|a|GGcGA|cttccac|TCaCC|aaa-t|CTTAA|TcactaA----|TTAAG|GAAGAGC|agtgacccttacaaccacacttatgacaacctccatattagccaccctact Abronia_graminea green arboreal alligator lizard Anguimorpha atgtagtctgactatttctatatgcatcgatctactgatgaggctcct|ACTCTTT|ta|GTAC|aacta------|GTAC|a|AGTGA|cttccaa|TCACT|aaa-t|CTTAg|cct--------|aTAAG|AAAGAGT|aatgacaatcctcctaataattgtattatcatttattatctctaccgcact Shinisaurus_crocodilurus crocodile lizard Anguimorpha acgtagtgtgattgttcttattcatctcaatttactgatgaggatcat|ACTCTTC|ta|GTAC|aacta------|GTAC|c|tGTGA|cttccac|TCACt|taa-t|CTTAA|cctctcgcc--|TTAAG|GAAGAGT|aatgaacctagtgatcatactaaccataacaatagtagtagccaccttaat Cordylus_warreni Warren's spiny-tail lizard Scincomorpha acgttgtttggctcttcctttatgtttcaatctactgatgaggctctt|aTTCTTC|ta|GTAT|taata------|GTAC|a|AGTGA|cttccac|TCACT|aag-a|CTCAG|cccaccc----|CTGAG|GAAGAAc|aataaacatcaataccatacttctaactaccaccctaatttccacactcct Eumeces_egregius mole skink Scincomorpha atgtcgtatgattattcctctacgtatcaatctactgatgaggttcat|ATTCTTC|ta|GTAT|tatta------|GTAC|a|AGTGA|cttccaa|TCACT|aag-t|CTCAG|cttaacc----|CTGAG|GAGGAAT|aatgagcataactaccatatttatcaccgctaccaccattaccgccctact Gekko_gecko tokay Gekkota atgttgtctgactgttcctatatatctcaatctactgatggggttcat|aTGTTCC|ta|GTAT|aata-------|ATAC|a|AGTGA|tttccac|TCACT|aaa-t|CCTAG|aacaccac---|CTAGG|GGAACAc|agtgttaattacttcactaatactactcatcctactttcaatagccatact Teratoscincus_keyserlingii giant frog-eyed gecko Gekkota acgttgtgtgactcttcctctatatctcaatctactgatgaggctcat|aCCCCCT|ga|GTAT|gcaa-------|GTAC|a|GATAA|tttccac|TTATC|aag-c|CTTAG|tcaacc-----|CTAAG|AGGGGGc|aattatactcattaacatactacttatttcaacagtcctcaccggagctct Acrochordus_granulatus little file snake Serpentes atattgtatgattattcctcttcatctcagtatattgatgaggctcat|gcTTCTT|ta|GTAT|ataa-------|GTAC|a|AATGC|cttccaa|GCATT|tag-t|CCC--|cccc-------|--GGG|AAGAAac|aattaacctaatcttattatcaacaatatcaataattatcaccatattact Boa_constrictor boa Serpentes acgtcgtgtggttattcctattcgtatctgtatactgatggggatcat|ATTTCTT|tA|GTAT|attatta----|GTAC|T|GATGC|cttccaa|GCATC|aag-a|TCCgc|-----------|caGGG|AAGAAAT|aataagcctcataacactatcaattatatcactattgcttacaatactact Cylindrophis_ruffus red-tailed pipe snake Serpentes acgtagtgtgactattcctattcgtctcagtttattgatgaggctcat|ATTTCTT|ta|GTAT|agta-------|GTAC|a|AATGC|cttccaa|GCATT|tcg-c|CCCgc|-----------|caGGG|AAGAAAT|aataaacctgatcgccctactaataatttcactatccgtagcaacactctt Dinodon_semicarinatus colubrid snake Serpentes atattgtctgactgttcttatacatctcggtatactgatgagggtcct|ATTTCTT|ta|GTAT|acta-------|GTAC|a|AATGC|cttccaa|GCATT|aag-a|CCCcc|-----------|ccGGG|AAGAAAT|aattaacctcatcacccttattattatggccatagcaataacaaccgccct Leptotyphlops_dulcis Texas_blind_snake Serpentes 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